Do zadań Centralnego Laboratorium należy sprawowanie funkcji laboratorium referencyjnego w rozumieniu przepisów Unii Europejskiej odnoszących się do mięsa drobiowego oraz wykonywanie badań laboratoryjnych w próbkach artykułów rolno-spożywczych, a w szczególności:
- wykonywanie analiz laboratoryjnych zleconych przez Główny Inspektorat,
- wykonywanie analiz specjalistycznych na rzecz innych laboratoriów Głównego Inspektoratu lub wojewódzkich inspektoratów JHARS, według zasad określonych przez Głównego Inspektora,
- współpraca z Biurem Orzecznictwa, Legislacji i Laboratoriów przy analizowaniu
projektów planów analitycznych i opracowywaniu planów działań laboratoryjnych
z uwzględnieniem zakresu i ilości próbek do analizy,
- współtworzenie rocznych programów szkoleń dla laboratoriów Inspekcji,
- wykonywanie wynikających z możliwości analitycznych analiz odwoławczych,
- organizowanie i koordynowanie badań biegłości włącznie z porównawczymi
dla laboratoriów Głównego Inspektoratu i zewnętrznych oraz udział w badaniach międzylaboratoryjnych,
- wprowadzanie w Laboratorium i koordynowanie wprowadzania nowych metod badawczych w oparciu o plany kontroli i zadania delegowane w zakresie wynikającym z kompetencji i możliwości analitycznych laboratoriów głównego Inspektoratu,
w uzgodnieniu z Biurem Orzecznictwa, Legislacji i Laboratoriów,
- organizowanie szkoleń w zakresie wynikającym z kompetencji i możliwości analitycznych Laboratorium,
- uczestniczenie w posiedzeniach Komitetów Technicznych PKN oraz opiniowanie projektów norm,
- współpraca z komórkami organizacyjnymi Ministerstwa Rolnictwa i Rozwoju Wsi,
wojewódzkimi inspektoratami JHARS, biurami Głównego Inspektoratu oraz jednostkami realizującymi politykę rolną państwa w zakresie wynikającym z zadań Laboratorium,
- współpraca z organizacjami branżowymi w zakresie wynikającym z kompetencji Laboratorium,
- prowadzenie biblioteki norm dotyczących artykułów rolno-spożywczych na potrzeby Laboratorium,
- opracowywanie i realizacja rocznego planu wydatków budżetowych oraz przygotowywanie opisów przedmiotów zamówienia do postępowań przetargowych,
- wykonywanie czynności w ramach funkcjonującego w Laboratorium Systemu Zarządzania,
- wykonywanie innych zadań zleconych przez kierownictwo Głównego Inspektoratu.